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中新網(wǎng)成都8月15日電 (記者 賀劭清)記者15日從中科院成都生物研究所獲悉，中科院成都生物研究所植物多樣性研究團(tuán)隊(duì)利用Illumina測(cè)序技術(shù)分別研究了極小種群之一的巴郎山杓蘭和對(duì)葉杓蘭的葉綠體基因組特征，并基于葉綠體基因組數(shù)據(jù)重建了蘭科植物5個(gè)亞科中的47個(gè)物種的系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)，為闡明杓蘭屬和蘭科植物的系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系和分類關(guān)系作出了重要貢獻(xiàn)。
據(jù)了解，蘭科是被子植物中最大的兩個(gè)科之一，由大約880個(gè)屬和27000個(gè)種組成，占所有維管植物物種的8%。蘭科杓蘭屬植物具有獨(dú)特的彩色唇瓣，具有極高的觀賞和經(jīng)濟(jì)價(jià)值，主要分布在北半球的溫帶地區(qū)。在野外，由于自然棲息地的退化和人為過(guò)度采集，該屬的許多物種已經(jīng)變得非常稀有和極度瀕危。截至目前該屬的全部物種均被列入瀕危野生動(dòng)植物國(guó)際貿(mào)易公約。
中科院成都生物研究所植物多樣性研究團(tuán)隊(duì)首次報(bào)道了巴郎山杓蘭和對(duì)葉杓蘭的葉綠體基因組特征，兩個(gè)基因組長(zhǎng)度為162,773-207,142 bp，包含128-130個(gè)基因，包括82-84個(gè)蛋白編碼基因，38個(gè)tRNA基因和8個(gè)rRNA基因；共定義了2,192個(gè)簡(jiǎn)單序列重復(fù)(SSRs)，786個(gè)長(zhǎng)重復(fù)序列(LSRs)和7,929個(gè)可變位點(diǎn)(High Variable Loci)；確定了12個(gè)高度多態(tài)的基因座(Pi>0.09)，適合于未來(lái)推斷杓蘭屬物種的系統(tǒng)發(fā)育。
此外，研究團(tuán)隊(duì)還揭示了該屬葉綠體基因組顯著擴(kuò)增的機(jī)制，并討論了IR區(qū)的擴(kuò)增導(dǎo)致SSC區(qū)的基因假基因化或丟失。同時(shí)，基于葉綠體基因組數(shù)據(jù)構(gòu)建的系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)為解決蘭科植物的系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系提供了新的見(jiàn)解。
相關(guān)研究成果近期以《Comparative chloroplast genomics of seven endangered Cypripedium species and phylogenetic relationships of Orchidaceae》為題發(fā)表在《Frontiers in Plant Science》。中國(guó)科學(xué)院成都生物所和重慶師范大學(xué)聯(lián)合培養(yǎng)的碩士研究生張君議和中國(guó)科學(xué)院成都生物研究所廖敏博士為論文的共同第一作者，徐波副研究員為論文的通訊作者。相關(guān)研究得到了中國(guó)國(guó)家重點(diǎn)研發(fā)計(jì)劃、第二次青藏高原科學(xué)考察計(jì)劃和四川省野生植物共享與服務(wù)平臺(tái)的資助。(完)
標(biāo)簽： 中科院成都生物研究所
