萬(wàn)人基因篩查,預(yù)測(cè)疾病風(fēng)險(xiǎn)

2023-08-01 14:14:36

美國(guó)俄勒岡健康與科學(xué)大學(xué)的一個(gè)臨床實(shí)驗(yàn)室團(tuán)隊(duì)希望通過為俄勒岡州所有成年人提供免費(fèi)的遺傳性癌癥和家族性高膽固醇血癥基因篩查來改變?cè)撝菥用竦倪@種狀況。自2018年起,該團(tuán)隊(duì)篩查了13000多名當(dāng)?shù)鼐用瘢账麄冊(cè)凇睹绹?guó)人類遺傳學(xué)雜志》上介紹了此次研究的方法、發(fā)現(xiàn)和經(jīng)驗(yàn)教訓(xùn)。


(資料圖片)

早期基因檢測(cè)可以改善癌癥預(yù)后,但如果缺乏家族史或負(fù)擔(dān)不起檢測(cè)費(fèi)用,人們通常不會(huì)接受這種篩查?!拔覀兿M@次的研究可以作為其他想要進(jìn)行低成本人口篩查的州的一個(gè)模型。”論文第一作者Timothy O’Brien說,“我們提供了一種路線圖,讓未來的篩查項(xiàng)目可以看看哪些是有效的,哪些可以改進(jìn)。”

該團(tuán)隊(duì)通過社交媒體廣告和農(nóng)貿(mào)市場(chǎng)等活動(dòng)招募參與者,他們還設(shè)置了自動(dòng)售貨機(jī),人們可以在那里取回和歸還收集漱口水唾液樣本的測(cè)試包。在新冠大流行暴發(fā)后,個(gè)人可以通過郵件申請(qǐng)檢測(cè)試劑盒。一旦參與者通過一個(gè)符合健康保險(xiǎn)流通與責(zé)任法案(HIPAA)的應(yīng)用程序表示同意,樣本就會(huì)在臨床實(shí)驗(yàn)室進(jìn)行處理,以篩選與遺傳性癌癥相關(guān)的31個(gè)基因和與家族性高膽固醇血癥相關(guān)的1個(gè)基因中的致病變異。

“我們希望報(bào)告任何被認(rèn)為是可操作的致病變異,這意味著你可以對(duì)此做些什么,比如改變你的習(xí)慣,進(jìn)行預(yù)防性手術(shù)或藥物治療,或者咨詢臨床醫(yī)生?!闭撐耐ㄓ嵶髡摺⒍砝諏】蹬c科學(xué)大學(xué)分子與醫(yī)學(xué)遺傳學(xué)榮譽(yù)教授Sue Richards說。

研究者在13000多名參與者中發(fā)現(xiàn),有710人的一種致病變異篩查呈陽(yáng)性。所有確認(rèn)陽(yáng)性結(jié)果的參與者都會(huì)接到遺傳咨詢師的電話,解釋他們的結(jié)果,以及該結(jié)果如何影響他們的疾病風(fēng)險(xiǎn)和醫(yī)療管理的建議。

“遺傳咨詢對(duì)這個(gè)項(xiàng)目至關(guān)重要。”Richards說,“公眾不容易理解這些基因檢測(cè)報(bào)告,因?yàn)樗鼈兊募夹g(shù)含量相當(dāng)高,僅僅攜帶致病變異并不意味著他們會(huì)患上那種癌癥。咨詢師不僅會(huì)告訴他們自己的健康狀況和家族史,還會(huì)告訴他們?nèi)绾螌⑦@些信息傳遞給其他家庭成員,因?yàn)樗麄円灿袛y帶這種變異的風(fēng)險(xiǎn)。”

當(dāng)實(shí)驗(yàn)室團(tuán)隊(duì)第一次開始這個(gè)項(xiàng)目時(shí),他們不得不將實(shí)驗(yàn)室的基因檢測(cè)工作流程擴(kuò)大到原有能力的10倍左右,方法是專注于一組選定的致病變異,并通過機(jī)器人的幫助執(zhí)行更繁瑣的任務(wù)。這使得該小組可以每月用1名實(shí)驗(yàn)室技術(shù)人員處理1000個(gè)樣本,估計(jì)每位參與者的成本為50美元。為了減少實(shí)驗(yàn)室混淆導(dǎo)致假陽(yáng)性的可能性,所有陽(yáng)性結(jié)果的參與者都被要求使用不同的基因測(cè)序方法進(jìn)行二次篩查。最終,研究人員報(bào)告說,在他們測(cè)序的20000個(gè)樣本中,沒有臨床相關(guān)的樣本混淆。

根據(jù)測(cè)序結(jié)果,研究人員還收集了大量數(shù)據(jù),可用于分析俄勒岡州人口的遺傳風(fēng)險(xiǎn)因素,并進(jìn)行額外的研究。大約5%的參與者在一種致病的遺傳性癌癥變異篩查中呈陽(yáng)性,這一比例高于之前幾項(xiàng)人群篩查研究報(bào)告的結(jié)果,這可能是因?yàn)橛袀€(gè)人或家族癌癥病史的人更有可能尋求檢測(cè)。

這種高于預(yù)期的患病率也可能是因?yàn)橄惹暗难芯亢Y選了一組不同的基因。美國(guó)醫(yī)學(xué)遺傳學(xué)和基因組學(xué)學(xué)院(ACMG)詳細(xì)列出了一組與個(gè)人狀況無關(guān)的基因,但建議在進(jìn)行臨床測(cè)試的患者中對(duì)其進(jìn)行分析。然而,如果只檢查這個(gè)列表中的基因,他們將錯(cuò)過研究人群中59%的致病變異。此外,研究中發(fā)現(xiàn)的最常見致病變異并不在ACMG的清單上。這突出表明,在大型篩查研究中,擴(kuò)大被檢測(cè)基因的范圍可以對(duì)獲得陽(yáng)性結(jié)果的人數(shù)產(chǎn)生重大影響。

該團(tuán)隊(duì)計(jì)劃在未來繼續(xù)他們的篩查項(xiàng)目,并加大努力,以覆蓋更多樣化的參與者群體。目前,76%的研究參與者是女性,因此該團(tuán)隊(duì)正在研究如何招募更多的男性參與者。此外,通過將他們使用的應(yīng)用程序翻譯成西班牙語(yǔ),研究人員打算接觸更多俄勒岡州講西班牙語(yǔ)的人口。

“這個(gè)項(xiàng)目的總體目標(biāo)是真正幫助俄勒岡人,讓他們掌握這些健康信息。”O(jiān)’Brien說,“我們覺得已經(jīng)能夠?qū)崿F(xiàn)這一目標(biāo),并希望它在未來繼續(xù)成為俄勒岡人健康的有力支持者?!?/p>

相關(guān)論文信息:

http://doi.org/10.1016/j.ajhg.2023.06.014

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