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科技日報北京4月3日電 （記者張夢然）美國北卡羅來納州立大學(xué)開發(fā)出全球首個用于植物病原體的新在線工具，將幫助研究人員識別、檢測和監(jiān)測疫霉屬物種，這些“植物破壞者”病害造成了1840年代毀滅性的愛爾蘭馬鈴薯饑荒，以及目前仍在美國西海岸蔓延的橡樹群體性死亡。研究發(fā)表在最新一期《公共科學(xué)圖書館·綜合》上。
疫霉屬第一個物種于1876年得到描述和命名。疫霉存在于空氣、土壤和水中，可導(dǎo)致糧食作物、觀賞植物和樹木患病。自2000年以來，研究人員已經(jīng)確定了大約150種新的疫霉屬物種。這是一個異常大量的植物病原體物種，許多疫霉屬物種具有廣泛的宿主范圍，因此它們可在更廣泛的區(qū)域“移動”。
此次構(gòu)建的“生命之樹”提供了關(guān)于超過192個正式描述的物種中的大量信息，包括它們的進化歷史和群體內(nèi)的關(guān)系，以及30多個其他非正式描述的分類單元。它還包括來自每個物種的遺傳藍(lán)圖或基因組上多個位置的基因序列數(shù)據(jù)。其他重要數(shù)據(jù)包括每個物種的全球位置、承載病原體的植物以及病原體在其植物宿主之中或之上的位置。
患病的植物就如同“沉默的病人”，但這一基于樹的比對選擇器（T-BAS）工具包，將所有已知的疫霉屬物種放入活的“生命之樹”中，還可將新出現(xiàn)的威脅物種放入開放獲取樹中，并查看哪些群體正在擴大和進化。新工具將使研究人員能夠?qū)崟r更新植物病害信息。
研究人員表示，預(yù)防疾病暴發(fā)的真正關(guān)鍵是在暴發(fā)之前抓住信號。T-BAS可用作疾病監(jiān)測和確定可能出現(xiàn)的下一個新譜系的工具。
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