天天熱點!華中農(nóng)大建成全球首個水稻基因索引數(shù)據(jù)庫

2023-04-10 16:55:17
央視新聞客戶端 發(fā)布時間:2023/4/10 16:59:51
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華中農(nóng)大建成全球首個水稻基因索引數(shù)據(jù)庫

 

華中農(nóng)業(yè)大學(xué)作物遺傳改良全國重點實驗室、湖北洪山實驗室張建偉教授課題組近日發(fā)表最新研究成果,他們建成世界上首個基于同源基因的水稻泛基因組綜合數(shù)據(jù)庫——水稻基因索引數(shù)據(jù)庫。

據(jù)介紹,這個數(shù)據(jù)庫如同一本近義詞詞典。在數(shù)據(jù)庫里,亞洲稻的每一個基因都能輕松找到同源或相近的基因,以及追蹤其演變歷史。目前,數(shù)據(jù)庫儲存于華中農(nóng)業(yè)大學(xué),向全球開放免費使用。

亞洲栽培稻是世界一半人口的主食。據(jù)記載,全球共有多達78萬份水稻種質(zhì)材料,其中國際水稻研究所種質(zhì)資源庫里收藏的亞洲稻種質(zhì)及其野生近緣種就達13萬多份。張建偉教授課題組所建成的水稻基因索引數(shù)據(jù)庫,是從13萬多份亞洲稻種質(zhì)中選取具有遺傳多樣性代表的3000份核心種植資源,再從3000份中選取最具代表性的16份,完成全基因組測序及基因注釋,作為其基本數(shù)據(jù)信息。

(總臺記者 許偉 彭照)

 
 
 
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華中農(nóng)業(yè)大學(xué)作物遺傳改良全國重點實驗室、湖北洪山實驗室張建偉教授課題組近日發(fā)表最新研究成果,他們建成世界上首個基于同源基因的水稻泛基因組綜合數(shù)據(jù)庫——水稻基因索引數(shù)據(jù)庫。

據(jù)介紹,這個數(shù)據(jù)庫如同一本近義詞詞典。在數(shù)據(jù)庫里,亞洲稻的每一個基因都能輕松找到同源或相近的基因,以及追蹤其演變歷史。目前,數(shù)據(jù)庫儲存于華中農(nóng)業(yè)大學(xué),向全球開放免費使用。

亞洲栽培稻是世界一半人口的主食。據(jù)記載,全球共有多達78萬份水稻種質(zhì)材料,其中國際水稻研究所種質(zhì)資源庫里收藏的亞洲稻種質(zhì)及其野生近緣種就達13萬多份。張建偉教授課題組所建成的水稻基因索引數(shù)據(jù)庫,是從13萬多份亞洲稻種質(zhì)中選取具有遺傳多樣性代表的3000份核心種植資源,再從3000份中選取最具代表性的16份,完成全基因組測序及基因注釋,作為其基本數(shù)據(jù)信息。

(總臺記者 許偉 彭照)

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