“不可成藥”靶點(diǎn)被攻克了?《科學(xué)》展示小分子藥新策略

2023-08-19 10:21:17

“很多年前科學(xué)家就開(kāi)始了對(duì)不可成藥靶點(diǎn)的研究,也有很多類似藥物進(jìn)入了臨床試驗(yàn)階段。雖然這項(xiàng)研究的概念和手段不算是原創(chuàng),但是要實(shí)現(xiàn)這樣的結(jié)果,特別是針對(duì)一個(gè)突變蛋白的激活態(tài),其實(shí)需要經(jīng)過(guò)大量深入嚴(yán)謹(jǐn)?shù)墓ぷ鳌!?/em>


(資料圖片)

當(dāng)?shù)貢r(shí)間8月17日,《科學(xué)》(Science)雜志發(fā)文稱,美國(guó)精準(zhǔn)腫瘤學(xué)醫(yī)藥企業(yè)Revolution Medicines和紀(jì)念斯隆-凱特琳癌癥中心(Memorial Sloan Kettering Cancer Cente)的科學(xué)團(tuán)隊(duì)展示了使用小分子藥物靶向“不可成藥”靶點(diǎn)的新策略。

KRAS蛋白曾經(jīng)是著名的“不可成藥”靶點(diǎn)。在這項(xiàng)研究中,科學(xué)家們?cè)噲D開(kāi)發(fā)針對(duì)激活狀態(tài)的KRAS G12C突變體的抑制劑。最終,他們開(kāi)發(fā)了基于化合物RMC-4998的激活態(tài)KRAS G12C分子膠抑制劑——RMC-6291。

目前,RMC-6291已進(jìn)入1/1b期臨床試驗(yàn),正在攜帶KRAS G12C突變體的實(shí)體瘤患者中評(píng)估其安全性并進(jìn)行劑量?jī)?yōu)化,最初的研究將聚焦于非小細(xì)胞肺癌患者,并可能包括結(jié)直腸癌患者。

在本次實(shí)驗(yàn)中,研究人員將注意力放在一個(gè)名為CYPA的分子伴侶蛋白上,CYPA最初作為免疫抑制藥物環(huán)孢菌素A(cyclosporin A)的受體被發(fā)現(xiàn)。它與環(huán)孢菌素A結(jié)合之后,能夠與鈣調(diào)磷酸酶(calcineurin)形成復(fù)合體并抑制磷酸酶活性。有趣的是,CYPA或環(huán)孢菌素A并不能獨(dú)自與鈣調(diào)磷酸酶結(jié)合。這一作用揭示了分子膠的作用機(jī)制——小分子藥物可以將兩個(gè)原本沒(méi)有相互作用的蛋白拉到一起來(lái)產(chǎn)生活性。

基于這一發(fā)現(xiàn),研究團(tuán)隊(duì)嘗試對(duì)與CYPA結(jié)合的天然產(chǎn)物進(jìn)行改造,經(jīng)過(guò)多輪基于結(jié)構(gòu)的化合物優(yōu)化,研究人員發(fā)現(xiàn)了名為RMC-4998的候選分子膠化合物。

論文作者指出,CYPA與激活狀態(tài)下KRAS G12C突變體結(jié)合的界面包含了多個(gè)氨基酸之間的相互作用,這種作用機(jī)制讓分子膠藥物能以更高的選擇性靶向抑制KRAS G12C的活性。而且,由于分子膠介導(dǎo)的相互作用,藥效更不容易因?yàn)镵RAS G12C或CYPA蛋白上出現(xiàn)的基因突變而受到抑制,這意味著針對(duì)RMC-4998和RMC-6291的耐藥性突變更難產(chǎn)生,因此它們?cè)谂R床應(yīng)用中可能表現(xiàn)出更持久的療效。

同期發(fā)布的評(píng)論文章指出,這種結(jié)合結(jié)構(gòu)生物學(xué)、理性設(shè)計(jì)和醫(yī)藥化學(xué)的設(shè)計(jì)方法,與高通量篩選相結(jié)合,有望更快開(kāi)發(fā)分子膠療法,靶向多種“不可成藥”靶點(diǎn)。

這并非醫(yī)學(xué)界第一次打破KRAS不可成藥“魔咒”。此前,科學(xué)家曾發(fā)現(xiàn)KRAS G12C突變體的半胱氨酸可以被共價(jià)小分子藥物靶向,這一突破最終帶來(lái)了美國(guó)食品藥品監(jiān)督管理局(FDA)批準(zhǔn)的兩款KRAS抑制劑——sotorasib和adagrasib,用于治療至少接受過(guò)一種前期全身治療的KRAS G12C突變非小細(xì)胞肺癌(NSCLC)患者,不過(guò)這些抑制劑均靶向KRAS G12C突變體的失活狀態(tài),而且患者可能在接受治療后產(chǎn)生耐藥性。

在清華大學(xué)、比爾及梅琳達(dá)·蓋茨基金會(huì)和北京市政府共同發(fā)起成立的獨(dú)立運(yùn)營(yíng)、非營(yíng)利性全球公共衛(wèi)生與藥物創(chuàng)新機(jī)構(gòu)——全球健康藥物研發(fā)中心(GHDDI)主任、清華大學(xué)藥學(xué)院創(chuàng)院院長(zhǎng)丁勝看來(lái),此項(xiàng)研究的意義在于工作量大、投入大,研究手段嚴(yán)謹(jǐn)深入?!捌鋵?shí)很多年前科學(xué)家就開(kāi)始了對(duì)不可成藥靶點(diǎn)的研究,也有很多類似藥物進(jìn)入了臨床試驗(yàn)階段。雖然這項(xiàng)研究的概念和手段不算是原創(chuàng),但是要實(shí)現(xiàn)這樣的結(jié)果,特別是針對(duì)一個(gè)突變蛋白的激活態(tài),其實(shí)需要經(jīng)過(guò)大量深入嚴(yán)謹(jǐn)?shù)墓ぷ??!倍俦硎荆瑢?shí)際上并非所有分子設(shè)計(jì)都能做到概念和手段都十分清晰,這就需要不斷做出調(diào)整和更改,且該實(shí)驗(yàn)由制藥公司牽頭主導(dǎo),所以投入比一般學(xué)校的實(shí)驗(yàn)室更多。

美國(guó)阿拉巴馬大學(xué)伯明翰分校遺傳學(xué)博士周葉斌向澎湃科技解釋,傳統(tǒng)小分子藥物往往是直接激活或抑制一個(gè)蛋白質(zhì),這只能適用于部分靶點(diǎn),也就帶來(lái)了“不可成藥靶點(diǎn)”的概念。KRAS是經(jīng)典的不可成藥靶點(diǎn),因?yàn)樗鳛橐粋€(gè)激酶和底物,結(jié)合能力非常強(qiáng),傳統(tǒng)小分子根本沒(méi)法插足。但KRAS G12C的突變,讓KRAS出現(xiàn)了傳統(tǒng)小分子能成藥的氨基酸位點(diǎn),這也是多個(gè)現(xiàn)在上市以及在研的KRAS藥物的成藥機(jī)理。不過(guò),周葉斌也表示,這仍然是一種偶然獲得的成藥可能。要讓更多不可成藥靶點(diǎn)成藥,就需要超越傳統(tǒng)小分子制藥技術(shù)。

據(jù)周葉斌介紹,現(xiàn)在比較熱門的技術(shù)有兩種,一種是PROTAC雙頭分子,它一頭和靶點(diǎn)結(jié)合,另一頭和降解蛋白質(zhì)的蛋白酶結(jié)合,能專門把某個(gè)蛋白降解掉,而不需要小分子直接抑制某個(gè)蛋白。另一種就是此實(shí)驗(yàn)中采用的分子膠技術(shù),這類小分子可以把兩個(gè)蛋白結(jié)合起來(lái),產(chǎn)生新的作用。比如在此研究中,分子膠把KRAS和另一種蛋白綁在一起,就阻斷了KRAS本身的功能。

“PROTAC和分子膠目前都還在驗(yàn)證階段。最缺一個(gè)成功藥物來(lái)證實(shí)這兩個(gè)技術(shù)的可行性和有效性。同時(shí),從應(yīng)用前景來(lái)說(shuō),這類新技術(shù)都可以看作一種全新的制藥方式,如果能有一個(gè)藥物驗(yàn)證成功,就有可能打開(kāi)一個(gè)全新的制藥方法,也能幫助我們大概確定適合這些技術(shù)的靶點(diǎn)特征,會(huì)大大擴(kuò)展?jié)撛诘男滤幯邪l(fā)可能?!敝苋~斌說(shuō)。

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