我所發(fā)展輔因子工程策略促進(jìn)天然產(chǎn)物生物合成

2022-04-30 09:56:10

近日,我所合成微生物學(xué)研究組(1823組)周雍進(jìn)研究員團(tuán)隊(duì)與海軍軍醫(yī)大學(xué)藥學(xué)系張磊教授合作,在酚酸類天然產(chǎn)物合成生物學(xué)研究方面取得新進(jìn)展。合作團(tuán)隊(duì)在釀酒酵母中構(gòu)建與優(yōu)化了酚酸生物合成途徑,強(qiáng)化了關(guān)鍵輔因子的供給和周轉(zhuǎn),實(shí)現(xiàn)了酚酸化合物的高效合成。

近年來,合成生物學(xué)快速發(fā)展使得天然產(chǎn)物可持續(xù)供應(yīng)走向現(xiàn)實(shí),在微生物細(xì)胞中構(gòu)建完整生物合成途徑,可實(shí)現(xiàn)系列復(fù)雜天然產(chǎn)物如青蒿酸、生物堿等的高效生物合成。釀酒酵母被廣泛應(yīng)用于食品釀造,且其具有極強(qiáng)的可塑性、魯棒性和可靠的安全性,逐漸成為構(gòu)建細(xì)胞工廠的主要平臺之一。目前,雖然酶工程和途徑工程已廣泛應(yīng)用于提高酵母細(xì)胞工廠的性能,但其用于合成天然產(chǎn)物的效率有待進(jìn)一步提高。

在上述背景下,合作團(tuán)隊(duì)致力于提升酚酸類天然產(chǎn)物合成效率。研究發(fā)現(xiàn),細(xì)胞內(nèi)輔因子參與的相關(guān)催化酶活性除了由酶表達(dá)量決定,還和輔因子水平有關(guān),特別是表達(dá)外源酶時往往會面臨輔因子不匹配或者供應(yīng)不足的限制。由此,周雍進(jìn)團(tuán)隊(duì)前期系統(tǒng)綜述了輔因子在天然產(chǎn)物合成中的重要價值,并提供了四種可行的輔因子工程方案:重建輔因子的生物合成;提升胞內(nèi)/細(xì)胞器內(nèi)輔因子的代謝水平;平衡輔因子的穩(wěn)態(tài),以及提高輔因子的活性形式(iScience,2020)。

酵母中酚酸化合物之一咖啡酸生物合成需要輔因子FAD(H2)和NADPH,而阿魏酸的生物合成需要SAM作為甲基供體。本工作中,團(tuán)隊(duì)通過改造中心代謝以提高NADPH供應(yīng)、構(gòu)建胞漿FAD(H2)合成途徑,以及將線粒體FAD(H2)導(dǎo)到胞漿以提高胞漿FAD(H2)供應(yīng)等方式,顯著提高了咖啡酸生物合成效率,使其產(chǎn)量達(dá)到5.5g/L,遠(yuǎn)高于文獻(xiàn)中已報道的0.8g/L。在此基礎(chǔ)上,團(tuán)隊(duì)利用高表達(dá)甲基轉(zhuǎn)移酶,構(gòu)建了阿魏酸生物合成途徑,進(jìn)一步強(qiáng)化了甲基循環(huán)以解除甲基轉(zhuǎn)移酶抑制效應(yīng),提高了甲基供體輔因子SAM水平和SAM周轉(zhuǎn),使得阿魏酸產(chǎn)量達(dá)到3.8g/L,遠(yuǎn)高于文獻(xiàn)中已報道的0.04g/L。該工作揭示了酵母中不同輔因子調(diào)控規(guī)律,特別是細(xì)胞內(nèi)不同細(xì)胞器之間的輔因子分配規(guī)律,為輔因子調(diào)控提供了理論指導(dǎo)。并且,該工作將為復(fù)雜活性天然產(chǎn)物(木脂素和多聚酚酸等)的高效合成提供充足前體,有望為天然產(chǎn)物新資源開發(fā)和瀕危中藥資源的可持續(xù)利用提供保障。

相關(guān)研究成果以“Engineering Cofactor Supply and Recycling to Drive Phenolic Acid Biosynthesis in Yeast”為題,于近日發(fā)表在《自然-化學(xué)生物學(xué)》(Nature Chemical Biology)上。該工作的第一作者是我所1823組博士后陳瑞兵。上述工作得到國家重點(diǎn)研究計劃、國家自然科學(xué)基金面上項(xiàng)目、國家自然科學(xué)基金優(yōu)秀青年基金、興遼英才計劃、我所科研創(chuàng)新基金等項(xiàng)目的資助。(文/圖 陳瑞兵)

文章鏈接:https://doi.org/10.1038/s41589-022-01014-6

標(biāo)簽: 天然產(chǎn)物 合成生物學(xué)

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