中國(guó)科大發(fā)現(xiàn)細(xì)菌游動(dòng)新模式

2022-03-31 21:51:34

中國(guó)科大物理系袁軍華、張榕京課題組通過(guò)聯(lián)合使用細(xì)菌三維追蹤技術(shù)與鞭毛絲動(dòng)態(tài)熒光觀察技術(shù),發(fā)現(xiàn)了銅綠假單胞菌(Pseudomonas aeruginosa)的新游動(dòng)模式。該研究結(jié)果于2022年3月29日發(fā)表在PNAS上[PNAS 119,e2120508119 (2022)]。

細(xì)菌運(yùn)動(dòng)是其生存和感染宿主的關(guān)鍵。細(xì)菌通過(guò)游動(dòng)模式之間的交替轉(zhuǎn)換來(lái)探索環(huán)境。不同于周身多鞭毛的大腸桿菌,銅綠假單胞菌是一種典型的極性單鞭毛細(xì)菌,其單根鞭毛位于桿狀胞體一端。在可旋轉(zhuǎn)鞭毛馬達(dá)的驅(qū)動(dòng)下,銅綠假單胞菌在液體中實(shí)現(xiàn)游動(dòng)模式切換:鞭毛逆時(shí)針旋轉(zhuǎn)時(shí)推動(dòng)胞體前進(jìn),鞭毛順時(shí)針旋轉(zhuǎn)時(shí)拖曳胞體后退。傳統(tǒng)認(rèn)為銅綠假單胞菌通過(guò)交替“前進(jìn)«后退”的方式實(shí)現(xiàn)環(huán)境探索,中間或許間隔著短暫的停頓。然而此方式下細(xì)菌游動(dòng)方向的改變主要源自布朗轉(zhuǎn)動(dòng)擴(kuò)散引起的胞體方向波動(dòng),因此對(duì)環(huán)境探索的效率不高。細(xì)菌經(jīng)過(guò)億萬(wàn)年的進(jìn)化,會(huì)不會(huì)有更高效的方式來(lái)探索環(huán)境呢?

圖1.細(xì)菌游動(dòng)的明場(chǎng)及熒光圖像。虛線代表細(xì)菌胞體,亮色代表熒光標(biāo)記的鞭毛絲,白色箭頭代表細(xì)菌游動(dòng)方向。

課題組借助基因編輯手段改進(jìn)了銅綠假單胞菌的鞭毛絲熒光標(biāo)記效率,在該細(xì)菌中實(shí)現(xiàn)了游動(dòng)三維追蹤及鞭毛絲動(dòng)態(tài)行為的同步觀測(cè),從而發(fā)現(xiàn)了一種全新游動(dòng)模式(如圖1,稱之為“wrap”模式),并且進(jìn)一步揭示了此模式發(fā)生的物理機(jī)制。鞭毛順時(shí)針轉(zhuǎn)動(dòng)時(shí),拖曳胞體后退,當(dāng)鞭毛變成逆時(shí)針轉(zhuǎn)動(dòng)時(shí),鞭毛絲靠近胞體的連接部件(鉤形鞘,hook)在兩端壓力的作用下發(fā)生力學(xué)屈曲失穩(wěn),使得鞭毛絲纏繞在胞體上,形成wrap態(tài)。在這種狀態(tài)下,胞體取向不穩(wěn)定從而容易發(fā)生轉(zhuǎn)向。Wrap態(tài)下屈曲的鉤形鞘兩端受拉力作用,經(jīng)過(guò)短暫間隙后(平均1秒)鞭毛絲從胞體解離,恢復(fù)成前進(jìn)態(tài)(如圖2)。因此,wrap態(tài)發(fā)生在由后退態(tài)切換到前進(jìn)態(tài)的過(guò)程中,經(jīng)統(tǒng)計(jì)其發(fā)生概率約40%。通過(guò)比較“后退®前進(jìn)”及“后退®wrap®前進(jìn)”這兩種方式下游動(dòng)方向改變的統(tǒng)計(jì)分布,課題組發(fā)現(xiàn)wrap態(tài)使得細(xì)菌游動(dòng)方向的改變隨機(jī)均勻地分布在4p立體空間,從而極大地提高了細(xì)菌探索環(huán)境的效率,另外通過(guò)對(duì)細(xì)菌趨化游動(dòng)的隨機(jī)動(dòng)力學(xué)模擬亦確證了wrap態(tài)在提升細(xì)菌趨化水平上的效力。

圖2. 銅綠假單胞菌游動(dòng)新模式。(左)圖1細(xì)菌的游動(dòng)軌跡示意圖,不同顏色代表不同游動(dòng)模式。(右)三種游動(dòng)模式下鞭毛絲的狀態(tài)。

在自然界中存在種類豐富的極性鞭毛細(xì)菌,課題組發(fā)現(xiàn)的游動(dòng)新模式可能在極性鞭毛細(xì)菌中廣泛存在。此處發(fā)現(xiàn)的由鉤形鞘力學(xué)屈曲失穩(wěn)來(lái)實(shí)現(xiàn)游動(dòng)方向改變的物理機(jī)制,對(duì)設(shè)計(jì)人工微納機(jī)器也有啟發(fā)。

課題組博士生田茂瑾、武征宇是本文共同第一作者。上述研究得到了國(guó)家自然科學(xué)基金委、科技部、合肥大科學(xué)中心協(xié)同創(chuàng)新培養(yǎng)基金的支持。

論文鏈接:https://www.pnas.org/doi/10.1073/pnas.2120508119

標(biāo)簽: 細(xì)菌游動(dòng) 銅綠假單胞菌

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